判决根据6月21日法庭公开审理时出示、质证的证据认定，2003年12月至2005年9月间，被告人曹文庄利用担任国家食品药品监督管理局药品注册司司长的职务便利，接受请托，为两家制药企业在药品的审批方面谋取利益，多次收受请托人给予的款项共计折合人民币240万余元。
2001年至2003年，曹文庄先后担任国家药品监督管理局药品注册司司长、国家食品药品监督管理局药品注册司司长期间，在全国范围统一换发药品批准文号专项工作中，不正确履行职责，对这一事关国计民生的药品生产监管工作未做深入调查研究和周密部署，草率提出启动专项工作和降低换发文号的审批标准。经后来抽查发现，曹文庄玩忽职守造成严重后果，部分药品生产企业使用虚假申报资料获得了国家统一的药品批准文号，其中包括个别假药。
法庭认为，曹文庄犯受贿罪，数额特别巨大，情节特别严重，在一审庭审中拒不供认犯罪事实，没有悔罪表现且不积极退缴赃款，论罪应当判处死刑。但鉴于曹文庄归案后提供线索，对侦破其他案件起到一定帮助作用，对其判处死刑可不立即执行。其所犯玩忽职守罪，使国家和人民利益遭受重大损失，情节特别严重，亦应依法惩处，与所犯受贿罪数罪并罚。遂依法作出上述判决。
北京市第一中级人民法院还于7月5日对国家药典委员会原秘书长王国荣、国家药典委员会业务综合处原副处长李智勇、国家食品药品监督管理局药品注册司原助理巡视员卢爱英、国家食品药品监督管理局原借调人员马腾四案作出一审宣判。认定王国荣犯受贿罪，判处无期徒刑，剥夺政治权利终身，没收个人财产人民币三十万元；认定李智勇犯受贿罪，判处有期徒刑十五年；认定卢爱英犯受贿罪、巨额财产来源不明罪，两罪并罚，决定执行有期徒刑十四年；认定马腾犯受贿罪判处有期徒刑十三年。
