蔡其华说，长江流域即将进入汛期，防汛成为热门话题。影响今年长江流域汛期旱涝趋势的气候因子主要特征是，去年冬天和今年春天发生强度偏弱的厄尔尼诺事件，一方面导致长江遭遇罕见的流域性枯水，局部地区甚至出现饮水困难的现象。另一方面青藏高原积雪偏多，而国内气温大部分偏高，必然导致积雪融水增多。
“应当警惕长江流域可能发生较大洪水。”蔡其华指出，长江流域今年的这些气象、水文特征与一九九八年十分相似，且长江已多年没有发生流域性大洪水。根据大洪水发生规律，今年长江发生流域性大洪水的可能性在增加，局部的暴雨洪水及其引发的洪涝灾害、台风灾害等影响更是不可低估。
蔡其华表示，虽然三峡大坝今年已经封顶，但库区的四期移民尚未完成，仍有两点八万人生活在一七五米水位线以下。倘若遭遇超过一八七0年(百年一遇)或千年一遇的大洪水，大坝拦蓄水位需达其设计的一百七十五米高程，才能保证其下游宜昌、沙市、武汉等城市安全，这样不仅需要临时移民两点八万人，而且三峡船闸也面临停航的危险，导致巨大的经济损失。所以库区调洪能力今年仍然有限。
同时，经过多年的除险加固，传统脆弱的长江中游荆江河段堤防，目前可抵御二十至五十年一遇的洪水标准，但一些支、干流堤防并未完全形成封闭圈，一些中小河流、中小水库依然是防汛的隐患，防汛形势依然不容乐观。
